Под заказ
Готовые NGS панели для таргетного обогащения Share Designs, Roche, Швейцария.
Оборудование может иметь разные конфигурации и комплектации, для более подробной информации обратитесь, пожалуйста, к нашим менеджерам
Описание
Готовые NGS панели для таргетного обогащения Share Designs были разработаны, как самой компанией Roche, так и в коллаборации с учеными из разных частей света. Портфолио панелей постоянно расширяется, в соответствие с возникающими потребностями в различных научных и клинических областях, таких как: онкология, генетика человека, сельское хозяйство и другие приложения.
Экзом кукурузы / Maize Exome Design
- SeqCap EZ Design: Maize Exome
- Организм: кукуруза
- Сборка генома: Maize (B73 and Mo17)
- Файлы дизайна: Предоставляются по запросу
- Коллабораторы: Доктор Патрик Шнабл и доктор Натан Спрингер
- Спецификации/детали: Панель Maize Exome была создана при сотрудничестве Roche Nimblegen, доктора Патрика Шнабла (Университет штата Айова) и доктора Натана Спрингера (Университет Миннесоты). Она основан на обширной коллекции 110 Мб экзонных регионов, полученных из эталонного генома B73, и экспрессированных последовательностей, не относящихся к B73, идентифицированных из инбредов-основателей популяции NAM и теосинта посредством RNA-Seq.
- Публикации/информация:
- Информация для заказа:
Тип продукта: SeqCap EZ Share Developer
Название дизайна: 130614_Maize_ISU_RNG_Zeaome_EZ_HX1
Внутренний референсный номер IRN #: 4000020170 - Каталожный номер:
24 реакции: 08333025001
96 реакций: 08333033001
384 реакции: 08333050001
Экзом ржи / Barley Exome Design
- SeqCap EZ Design: Barley Exome
- Организм: Barley
- Сборка генома: Hordeum vulgare (various), см. Приложенный файл barley_mapping_sequence.fa
- Файлы дизайна: Barley Exome Design
- Коллаборатор: Wheat Barley Exome Consortium (WBEC)
- Спецификации/детали: Панель Barley Exome представляет собой проект созданный консорциумом. Она основана на мРНК кодирующего экзома из нескольких источников с общим размером дизайна 88,6 Мб. Wheat Barley Exome Consortium - это совместная работа исследователей из Университета Ливерпуля, Института генетики растений и исследований сельскохозяйственных культур (IPK), Института Джеймса Хаттона, Канзасского государственного университета, Университета Миннесоты, Университета Саскачевана и BIOGEMMA.
- Публикации/информация:
- Информация для заказа:
Название дизайна: 120426_Barley_BEC_D04
Экзом пшеницы / Wheat Exome Design
- SeqCap EZ Design: Wheat Exome
- Организм: Wheat
- Сборка генома: Triticum aestivum (various), см. Приложенный файл wheat_mapping_sequence.fa
- Файлы дизайна: Wheat Exome Design
- Коллаборатор: Wheat Barley Exome Consortium (WBEC)
- Спецификации/детали:Панель Wheat Exome – это представляет собой проект представляет собой проект созданный консорциумом. Панель включает 106,9 Мб последовательности геномной ДНК из нескольких сортов пшеницы.Wheat Barley Exome Consortium - это совместная работа исследователей из Университета Ливерпуля, Института генетики растений и исследований сельскохозяйственных культур (IPK), Института Джеймса Хаттона, Канзасского государственного университета, Университета Миннесоты, Университета Саскачевана и BIOGEMMA.
- Публикации/информация:
- Информация для заказа:
Название дизайна: 120426_Wheat_WEC_D02
Экзом проса/Switchgrass Exome Design
- SeqCap EZ Design: Switchgrass Exome
- Организм: Просо
- Геномная сборка: Два набора транскриптов были использованы для разработки зондов. Сборка PlantGDB (Duvick et al., 2008) тегов экспрессированных последовательностей, полученных из P. virgatum метдом Сэнгера (Выпуск 181a; 120 524 уникальных транскриптов), и пользовательская сборка последовательностей транскриптов, полученных пиросеквенированием генома P. virgatum, загруженных из NCBI (SRR064785-SRR064802 ).
- Файлы дизайна: Switchgrass Exome
- Коллабораторы: Кэпплер и Стеф Чоу, Висконсинский университет, Мэдисон
- Спецификации/детали:Из аннотированных генов, был создан пул зондов общим размером 50 038 805 п.н., состоящих из 168 961 экзона в 44 873 генах в Выпуске 0 эталонного генома AP13.
- Публикации/информация:
- Nucleotide polymorphism and copy number variant detection using exome capture and next-generation sequencing in the polyploid grass Panicum virgatum The Plant Journal, (2014), 79, 993-1008
- Информация для заказа:
Тип продукта: SeqCap EZ Share Developer
Название дизайна: 120911_Switchgrass_GLBRC_R_EZ_HX1
Внутренний референсный номер IRN #:·4000021240 - Каталожный номер:
24 реакции: 08333025001
96 реакций: 08333033001
384 реакции: 08333050001
Экзом сои/Soy Exome Design
- SeqCap EZ Design: Soy Exome Design
- Организм: Соя
- Геномная сборка: Объединенный институт генома
- Файлы дизайна: Soy Exome Design
- Коллаборатор: Roche NimbleGen
- Спецификации/детали: Дизайн для экзома сои имеет размер 85.3Mb и покрывает 95.3% экзонов, составляющих 46367 генов сои. Мы рекомендуем использовать специальный реагент для блокировки повторов SeqCap EZ Developer Reagent (Cat. No.06684335001) для эффективно обогащения экзома сои.
- Публикации/информация:
- Информация для заказа:
Тип продукта: SeqCap EZ Share Developer
Название дизайна: 120403_Gmax_Exome_EZ_HX1
Внутренний референсный номер IRN #:· 4000007450 - Каталожный номер:
24 реакции: 08333025001
96 реакций: 08333033001
384 реакции: 08333050001
Более подробно можно ознакомиться на сайте компании-производителя