Под заказ
Готовые NGS панели для таргетного обогащения Share Designs, Roche, Швейцария.
Данная продукция предназначена только для научных исследований.
Данная продукция предназначена только для научных исследований.
Описание
Готовые NGS панели для таргетного обогащения Share Designs были разработаны, как самой компанией Roche, так и в коллаборации с учеными из разных частей света. Портфолио панелей постоянно расширяется, в соответствие с возникающими потребностями в научных областях, таких как: онкология, генетика человека, сельское хозяйство и другие приложения.
Экзом кукурузы / Maize Exome Design
- SeqCap EZ Design: Maize Exome
- Организм: кукуруза
- Сборка генома: Maize (B73 and Mo17)
- Файлы дизайна: Предоставляются по запросу
- Коллабораторы: Доктор Патрик Шнабл и доктор Натан Спрингер
- Спецификации/детали: Панель Maize Exome была создана при сотрудничестве Roche Nimblegen, доктора Патрика Шнабла (Университет штата Айова) и доктора Натана Спрингера (Университет Миннесоты). Она основан на обширной коллекции 110 Мб экзонных регионов, полученных из эталонного генома B73, и экспрессированных последовательностей, не относящихся к B73, идентифицированных из инбредов-основателей популяции NAM и теосинта посредством RNA-Seq.
- Публикации/информация:
- Информация для заказа:
Тип продукта: SeqCap EZ Share Developer
Название дизайна: 130614_Maize_ISU_RNG_Zeaome_EZ_HX1
Внутренний референсный номер IRN #: 4000020170 - Каталожный номер:
24 реакции: 08333025001
96 реакций: 08333033001
384 реакции: 08333050001
Экзом ржи / Barley Exome Design
- SeqCap EZ Design: Barley Exome
- Организм: Barley
- Сборка генома: Hordeum vulgare (various), см. Приложенный файл barley_mapping_sequence.fa
- Файлы дизайна: Barley Exome Design
- Коллаборатор: Wheat Barley Exome Consortium (WBEC)
- Спецификации/детали: Панель Barley Exome представляет собой проект созданный консорциумом. Она основана на мРНК кодирующего экзома из нескольких источников с общим размером дизайна 88,6 Мб. Wheat Barley Exome Consortium - это совместная работа исследователей из Университета Ливерпуля, Института генетики растений и исследований сельскохозяйственных культур (IPK), Института Джеймса Хаттона, Канзасского государственного университета, Университета Миннесоты, Университета Саскачевана и BIOGEMMA.
- Публикации/информация:
- Информация для заказа:
Название дизайна: 120426_Barley_BEC_D04
Экзом пшеницы / Wheat Exome Design
- SeqCap EZ Design: Wheat Exome
- Организм: Wheat
- Сборка генома: Triticum aestivum (various), см. Приложенный файл wheat_mapping_sequence.fa
- Файлы дизайна: Wheat Exome Design
- Коллаборатор: Wheat Barley Exome Consortium (WBEC)
- Спецификации/детали:Панель Wheat Exome – это представляет собой проект представляет собой проект созданный консорциумом. Панель включает 106,9 Мб последовательности геномной ДНК из нескольких сортов пшеницы.Wheat Barley Exome Consortium - это совместная работа исследователей из Университета Ливерпуля, Института генетики растений и исследований сельскохозяйственных культур (IPK), Института Джеймса Хаттона, Канзасского государственного университета, Университета Миннесоты, Университета Саскачевана и BIOGEMMA.
- Публикации/информация:
- Информация для заказа:
Название дизайна: 120426_Wheat_WEC_D02
Экзом проса/Switchgrass Exome Design
- SeqCap EZ Design: Switchgrass Exome
- Организм: Просо
- Геномная сборка: Два набора транскриптов были использованы для разработки зондов. Сборка PlantGDB (Duvick et al., 2008) тегов экспрессированных последовательностей, полученных из P. virgatum метдом Сэнгера (Выпуск 181a; 120 524 уникальных транскриптов), и пользовательская сборка последовательностей транскриптов, полученных пиросеквенированием генома P. virgatum, загруженных из NCBI (SRR064785-SRR064802 ).
- Файлы дизайна: Switchgrass Exome
- Коллабораторы: Кэпплер и Стеф Чоу, Висконсинский университет, Мэдисон
- Спецификации/детали:Из аннотированных генов, был создан пул зондов общим размером 50 038 805 п.н., состоящих из 168 961 экзона в 44 873 генах в Выпуске 0 эталонного генома AP13.
- Публикации/информация:
- Nucleotide polymorphism and copy number variant detection using exome capture and next-generation sequencing in the polyploid grass Panicum virgatum The Plant Journal, (2014), 79, 993-1008
- Информация для заказа:
Тип продукта: SeqCap EZ Share Developer
Название дизайна: 120911_Switchgrass_GLBRC_R_EZ_HX1
Внутренний референсный номер IRN #:·4000021240 - Каталожный номер:
24 реакции: 08333025001
96 реакций: 08333033001
384 реакции: 08333050001
Экзом сои/Soy Exome Design
- SeqCap EZ Design: Soy Exome Design
- Организм: Соя
- Геномная сборка: Объединенный институт генома
- Файлы дизайна: Soy Exome Design
- Коллаборатор: Roche NimbleGen
- Спецификации/детали: Дизайн для экзома сои имеет размер 85.3Mb и покрывает 95.3% экзонов, составляющих 46367 генов сои. Мы рекомендуем использовать специальный реагент для блокировки повторов SeqCap EZ Developer Reagent (Cat. No.06684335001) для эффективно обогащения экзома сои.
- Публикации/информация:
- Информация для заказа:
Тип продукта: SeqCap EZ Share Developer
Название дизайна: 120403_Gmax_Exome_EZ_HX1
Внутренний референсный номер IRN #:· 4000007450 - Каталожный номер:
24 реакции: 08333025001
96 реакций: 08333033001
384 реакции: 08333050001
Более подробно можно ознакомиться на сайте компании-производителя