- Описание
- Готовые NGS панели для таргетного обогащения Share Designs были разработаны, как самой компанией Roche, так и в коллаборации с учеными из разных частей света. Портфолио панелей постоянно расширяется, в соответствие с возникающими потребностями в научных областях, таких как: онкология, генетика человека, сельское хозяйство и другие приложения.
Панель Прайм экзом/ SeqCap EZ Prime Exome Design
- Организм: человек
- Сборка генома: HG38
- Файлы дизайна: SeqCap EZ Prime Exom
- Демо данные: Предоставляются по запросу
- Спецификации/детали: Экзомная панель SeqCap EZ Prime Exome обеспечивает улучшенную равномерность/гомогенность покрытия полного экзома при минимальном объеме данных NGS. SeqCap EZ Prime Exome содержит зонды, покрывающие 98.1% кодирующих регионов из базы CCDS Release 20 (8 Сентября, 2016), обеспечивая захват 37 Mb таргетных участков. Панель также обеспечивает покрытие 340 SNP для отслеживания образца, имеющихся в различных коммерческих наборах, для облегчения идентификации образца во время обработки данных.
- Информация для заказа:
Тип продукта: SeqCap EZ Share Prime Choice XL
Название дизайна: 170907_HG38_CCDS1X_REZ_HX1
Внутренний референсный номер IRN #: 4000035460 - Каталожный номер:
24 реакции: 08333092001
96 реакций: 08333114001
384 реакции: 08333122001
Панель CNV/LOH Backbone Design
- Организм: человек
- Сборка генома: HG38
- Файлы дизайна: SeqCap EZ CNV/LOH Backbone Design
- Демо данные: Предоставляются по запросу
- Спецификации/детали: Панель SeqCap EZ CNV/LOH Backbone Design покрывает геном человека hg38 на интервалах 50 kb. Зонды, положенные на остов ДНК, покрывают тщательно отобранные high MAF (Minor Allele Frequency) SNPs вне экзонных регионов, для выявления, как вариантов количества копий CNV (Copy Number Variation), так и потери гетерозиготности LOH (Loss of Heterozygosity). Зонды комплементарны соседним участкам high MAF SNPs для предотвращения ошибок любого сдвига референсных аллелей. Размер дизайна - 3.8 Mb. Дизайн может быть использован, как в качестве самостоятельной панели, так и смешиваться с другими панелями с фиксированным или кастомным составом, давая возможность одновременно обнаруживать SNP/инделы и CNV/LOH в рамках одного NGS исследования.
- Информация для заказа:
Тип продукта: SeqCap EZ Share Prime Choice Probes
Название дизайна: 170104_HG38_CNV_LOH_EZ_HX3
Внутренний референсный номер IRN #: 4000034070 - Каталожный номер:
24 реакции: 08333068001
96 реакций: 08333076001
384 реакции: 08333084001
Панель Наследственные заболевания / Inherited Disease Panel
- Организм: человек
- Сборка генома: HG38
- Файлы дизайна: IDP Design
- Демо данные: Предоставляются по запросу
- Коллаборатор: Доктор Джейсон Парк
- Спецификации/детали: Панель SeqCap EZ Inherited Disease покрывает 4100 генов и регионов, ассоциированных с наследственными заболеваниями. Она была создана в совместной коллаборации Roche Sequencing и Доктора Джейсона Парка. Общий размер дизайна (hg38) составляет 9.0 Mb первичных мишеней и 11.8 Mb захватываемых мишеней.
- Информация для заказа:
Тип продукта: SeqCap EZ Share Choice XL
Название дизайна: 150803_HG38_IDP2_REZ_HX3
Внутренний референсный номер IRN #: 4000024240 - Каталожный номер:
24 реакции: 08332991001
96 реакций: 08333009001
384 реакции: 08333017001
Панель Главный комплекс гистосовместимости человека / Человек MHC Design
- SeqCap EZ Design: Человек MHC Design
- Организм: человек
- Сборка генома: HG19
- Файлы дизайна: Человек MHC Design
- Коллаборатор: BGI
- Спецификации/детали: Панель покрывает регион MHC (3.37Mb), 1.6Mb регионов окружающих MHC и 8 известных гаплотипов MHC c общим размером дизайна 4.97Mb.
- Информация для заказа:
Тип продукта: SeqCap EZ Share Choice
Название дизайна: 110729_HG19_MHC_L2R_D03_EZ
Внутренний референсный номер IRN #:·4000032110 - Каталожный номер:
24 реакции: 08332967001
96 реакций: 08332975001
384 реакции: 08332983001